江西省團隊研發出首款國產水稻20K固相芯片“中芯稻1號”,使檢測成本大幅降低——
水稻育種加速跑進“智慧時代”
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收藏俗話說,種子是農業的“芯片”,而芯片本身也是育種的一個關鍵利器。有沒有一款芯片,能迅速檢測出一粒水稻種子是否具有抗旱、高產、抗倒伏等基因信息呢?答案:有。
眼下正值春耕,我省水稻育種領域傳來喜訊。繼發布首款國產甘藍型油菜20K(2萬個遺傳信息位點)固相芯片“中芯油1號”后,省農科院又推出首款國產水稻通用型20K固相芯片——“中芯稻1號”,打破分子育種固相基因芯片被國外企業壟斷的局面,推動水稻育種從經驗育種向智慧育種跨越。
繪制一張水稻基因的“高精度地圖”
“通俗地說,這款芯片相當於研發團隊繪制出一張水稻基因的‘高精度地圖’,集納大規模水稻基因數據,能滿足水稻基因體檢、品種指紋圖譜鑒定、基因定位、人工智能育種等遺傳育種應用。”省農科院生物育種創新中心聶元元博士介紹,“中芯稻1號”是我省團隊研發的國內首款擁有完全自主知識產權的固相芯片,涵蓋探針數量超2萬個。
“中芯稻1號”具有什麼樣的特性和優勢?
專家介紹,通過“中芯稻1號”對水稻幼苗甚至種子進行基因掃描,可一次性完成功能基因檢測、品種指紋圖譜鑒定、籼粳成分鑒定、轉基因成分檢測、抗旱基因位點鑒定、東鄉野生稻特異片段鑒定等六大功能模塊分析,精准篩選出水稻“優等生”。以前傳統育種,專家要在田間觀察株高、抗性、產量等性狀,育成一個品種通常需要8至10年時間,如今借助“中芯稻1號”可將育種時間縮短到3年。
據介紹,與價格高昂的進口芯片相比,“中芯稻1號”最大的優勢是物美價廉,其從設計到制備、檢測實現全鏈條國產化,檢測成本大幅降低至普通育種單位均能承受的水平。聶元元說:“過去從國外進口芯片一塊要300多元,而這款芯片價格只要20多元。”
水稻向智能化設計育種邁進
眼下,省農科院生物育種創新中心實驗室內人氣頗旺,不少省內種業公司負責人攜帶水稻種子前來檢測。江西匯豐源種業有限公司相關負責人陳建新告訴記者,公司將自主選育的“祥兩優瑞香”等籼稻品種送來檢測,希望全面了解這些品種基因信息,為選育下一批水稻“優等生”奠定基礎。
對於種子公司來說,“中芯稻1號”不僅可以滿足一般遺傳育種研究需求,還可以針對特色育種需求進行設計。作為我省獨有的珍貴野生稻資源,東鄉野生稻蘊含抗寒、抗病、高產等優異基因,“中芯稻1號”專門開發了抗旱基因位點鑒定和東鄉野生稻特異片段鑒定模塊,可精准追蹤這些優良性狀在育種后代中的留存情況,為挖掘利用野生稻優異基因提供高效工具。
記者了解到,省農科院已在國內率先打造水稻育種全自動化檢測分析平台,立足“中芯稻1號”為全省及全國水稻育種工作者提供全基因組關聯分析、全基因組選擇、轉基因檢測、品種真實性鑒定、人工智能育種等領域的基因檢測服務。
省農科院黨委副書記、院長易龍表示,“中芯稻1號”的研發成功,不僅填補了國內水稻固相芯片領域的空白,更將推動我省育種模式從傳統育種向智慧育種轉型,這是我省“人工智能+”賦能傳統農業轉型升級的一項重要成果。
業內專家表示,當前水稻育種已全面進入分子育種時代,正向智能化設計育種邁進,固相芯片技術因其檢測位點固定、分型准確度高、重復性好、周期短、操作門檻低等優勢,正成為全基因組基因檢測的理想選擇。(記者 陳旻 實習生 吳佳欣)
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